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·PNA凝固点差异于DNA。鉴于PNA链是不会导电连接的，PNA-DNA的Tm值会比相对应的DNA-DNA的高。一般环境下，100mMNaCl中，每增强某个碱基，其Tm值上升约1°C。在较低盐浓硫酸浓度下，其Tm值的对比将比较突出。常，是一个含10个碱基PNA，其Tm值约50°C，含15个碱基的PNATm值约70°C。

段长度为12～17个碱基的PNA字段。字段时间常见决定于其具体实施利用。与DNA的利用好于，PNA测试探针字段可以的时间更短。链长的PNA，表明字段，趋势于聚合物，难以纯化和研究方法。以至于，字段短些，特女性朋友越差。因，这对于短字段来说就，不适应的影向挺大。

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